Fiji: Procesamiento de imágenes para biotecnología y toxicología

Introducción a Fiji e ImageJ

• Descripción general de Fiji y sus aplicaciones en la investigación científica
• Comprensión de la arquitectura y los complementos (plugins) de ImageJ
• Instalación y configuración de Fiji para un rendimiento óptimo

Técnicas básicas de procesamiento de imágenes

• Adquisición de imágenes y formatos de importación
• Ajuste del contraste, el brillo y aplicación de filtros
• Métodos de apilamiento y proyección de imágenes

Análisis avanzado de imágenes

• Técnicas de segmentación: umbralización y detección de bordes
• Conteo de objetos y análisis de partículas en muestras histológicas
• Medición de áreas, perímetros y otras características morfológicas

Trabajo con muestras biológicas

• Procesamiento de imágenes de tejidos histológicos, glóbulos rojos y algas
• Desconvolución del color y análisis de tejidos teñidos
• Análisis de lapso de tiempo y seguimiento del movimiento celular

Automatización y personalización

• Creación y ejecución de macros para tareas repetitivas
• Uso de complementos (plugins) de Fiji para análisis especializados
• Scripting básico con el lenguaje de macros de ImageJ (IJM)

Gestión de datos y generación de informes

• Exportación de resultados y generación de informes
• Anotación de imágenes y preparación de datos para su publicación
• Mejores prácticas para el análisis reproducible de imágenes

Resumen y próximos pasos